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ANNUAIRE REGIONAL DU RESEAU RECHERCHE

Identité du laboratoire :
Laboratoire de traitement de l’information médicale LaTIM


Lieu d’implantation : CHRU de Brest

Coordonnées :
5 avenue Foch 29609 Brest
Site internet : www.latim-univ-brest.fr

Adresse courriel :
Christian.roux@telecom-bretagne.eu
Eric.stindel@univ-brest.fr
Directeur :
Christian ROUX (jusque fin 2011) Eric STINDEL à partir de 2012
Présentation du laboratoire :
Le LaTIM développe une recherche multidisciplinaire dans laquelle sciences de l’information et sciences de la santé s’enrichissent mutuellement via des échanges constants entre les deux domaines. La démarche scientifique, fondée sur l’information et la connaissance, y est mise en confrontation constante avec les réalités technologiques et cliniques propres au domaine médical. Les méthodes développées se doivent alors de répondre à ses spécificités, en particulier à son niveau d’exigence très élevé (précision, robustesse, temps réel). Ces contraintes nous conduisent à proposer des solutions particulièrement efficientes, le plus souvent génériques, à même d’être facilement utilisées dans d’autres secteurs d’application des STIC à contraintes de performances moins fortes. Née de la complémentarité entre les domaines des STIC et de la santé, la recherche est conduite par une équipe multidisciplinaire associant des membres issus de l’Université de Bretagne Occidentale, de Telecom Bretagne, de l’INSERM et du CHU de Brest. La recherche de l’unité s’organise selon trois axes thématiques principaux : Gestion des données Médicales Multimodales Partagées pour l’aide à la décision (GD2MP), thérapies non interventionnelles, thérapies interventionnelles et deux plateformes technologiques. Contexte et équipe (personnes ressources)
Composition ou organigramme de l’équipe de recherche :

Equipe de direction :
• Directeurs adjoints : D. Visvikis (INSERM), C. Hamitouche (Telecom Bretagne) Pour en augmenter l’efficacité, l’équipe de direction du laboratoire a été constituée de façon à
disposer en son sein d’un représentant de chacune de ses tutelles. Cette équipe s’appuie sur un
conseil de direction :

Conseil de Direction

• Responsable de la cellule d’analyse du mouvement : Pr. Olivier Remy-Neris • Pr. Christian Roux, Fondateur et directeur de l’unité U650 LaTIM 2006_2010, es-qualité • Attachée de gestion : D. Alvez (INSERM) Responsables des plateformes :
• Plateforme bretonne d’innovation en Imagerie Médicale et Action Thérapeutique Guidée par • Plateforme de calculs scientifiques intensifs et simulation numérique : D. Visvikis • Plateforme technologique d’acquisition et d’analyse des signaux cardio-ventilatoires en charge des relations avec le Centre de Simulation de l’université : E. L’Her Gestion des données Médicales Multimodales Partagées pour l’aide à la décision (GD2MP) : Responsable de Groupe : Guy Cazuguel, Directeur d’Etude à Télécom Bretagne Thérapies non interventionnelles : Responsable de groupe - Dimitris Visvikis, directeur de recherche INSERM. Thérapie interventionnelle : Responsable de groupe - Chafiaâ Hamitouche, Professeur à Telecom Bretagne. Au sein de ce dernier groupe, le Pr Rémy-Néris anime la thématique sur sport et santé. Recherche et développement
Axes de recherche,
L’orientation principale du laboratoire est l’optimisation des actions thérapeutiques par
intégration d’informations multimodales
L’activité du laboratoire s’inscrit dans une politique générale visant à fournir une information
structurée au sein de modèles personnalisés, en assurant un haut niveau de qualité à l’ensemble
des processus mis en œuvre. Les thèmes de recherche principaux sont
La Gestion des données Médicales Multimodales Partagées pour l’aide à la décision avec deux
sous thèmes

1. Indexation des données et recherche d'informations multimodales
2. Sécurisation des donnée
Les thérapies non interventionnelles avec deux sous thèmes
1. Détermination et suivi de la réponse thérapeutique
2. Imagerie multimodale pour la planification du traitement en radiothérapie

2.1. Amélioration de la qualité des images synchronisées sur le mouvement
2.2.
Modélisation et combinaison de l’imagerie fonctionnelle multi-traceurs
Les thérapies interventionnelles avec quatre sous thèmes
1. Modèles Biomécaniques précis
2. Environnement musculo-ligamentaire et modèles d’évolution physiopathologique.
3. Modélisation multi-échelles
4. Prothèses auto-adaptatives à énergie renouvelable
Dans le domaine du sport
Le principal axe de recherche s’intégrera dans le dernier axe du laboratoire, concernant l’appareil
ostéoarticulaire. Le principal travail actuel concerne la prévention du risque sportif en particulier
locomoteur (risque de lésion des ligaments du genou). Cet axe est fortement structuré à partir
d’une des plateformes technologiques du LaTIM qui comporte un système de mesure du
mouvement permettant l’étude du mouvement sportif tel qu’il est pratiqué et des systèmes
d’imagerie de l’appareil locomoteur innovants (système EOS en particulier). Nous sommes aussi en
lien très structuré avec le centre de médecine du sport de Brest Métropole océane qui participe à
nos travaux. L’un des axes principaux du laboratoire étant la multimodalité c'est-à-dire le couplage
personnalisé d’informations venant de différents dispositifs médicaux, nous nous proposons de
travailler dans un but d’évaluer le risque de la pratique.
Thèmes de travail,
Le principal thème actuel concerne l’identification des éléments du geste sportif pouvant
occasionner une lésion des ligaments du genoux. Accident majeur et très fréquent dans les sports
pivots, cette thématique est majeure dans le domaine de la santé et du sport.
Spécificités par domaine de recherche,
La grande spécificité de notre laboratoire repose sur une structuration forte sur des plateformes
technologiques de calcul d’une part et d’exploration médicale d’autre part. La multimodalité
(fusion des données venant de différents appareils de mesure) est au cœur de la démarche du
laboratoire.
Publications repères,
La liste des publications pour 2009 et 2010 de notre laboratoire est mise en annexe de ce
document
La démarche d’intégration dans le milieu du sport-santé de la démarche du laboratoire est
récente. Une première publication au congrès européen de médecine du sport (Kinematics during a
sidestep maneuver in handball: Study of the influence of gender Salzburg nov 2011) a été
acceptée. Des publications écrites sont en cours.
Champs d’application
Exemple de dispositif de coopération avec le mouvement sportif,

-dans le secteur du sport de haut niveau :

Dans le cadre du projet ci-dessous, un développement sur le sport de haut niveau est souhaitable.
-dans le secteur du sport-santé :
Une coopération forte s’est mise en place entre le Centre de médecine du sport de la communauté urbaine de Brest (BMO) et le laboratoire d’analyse du mouvement du CHRU, partie constitutive d’une des plateformes technologiques du LaTIM Cette collaboration a permis d’intégrer dans le LaTIM un enseignant-chercheur de l’UFR STAPS (Maitre de conférence) de l’UBO en plus des enseignants chercheurs et praticiens du CHRU et du CMS. L’objectif de la montée en charge progressive du dispositif est de développer entre le CMS et le CHRU une plateforme de prévention du risque sportif comportant un volet locomoteur fort et progressivement d’autres composantes (en particulier cardiovasculaire). Cette plateforme en constitution aura pour objectif de permettre une exploration rationnelle, fortement -dans le secteur du sport pour tous :
La coopération avec le CMS a permis d’ouvrir une coopération forte vers le sport pour tous. Au-
delà des travaux de recherche, la prise en charge des sportifs est assurée par le CMS. Cette
coopération va s’étendre vers l’UBO avec la mise en place d’un support pérenne à l’activité de
prévention du SUAPS (service universitaire des activités physiques et sportives).

-autres :
Mise en réseau de l’annuaire régional
Quelles sont vos besoins, attentes, suggestions qui permettraient
de valoriser et dynamiser la mise en réseau de cet annuaire ?

Nos attentes sont une structuration régionale et l’organisation d’une activité scientifique régionale sur la
thématique du sport.
ACL (Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité de lecture
répertoriées par l’AERES ou dans les bases de données internationales)

1. Brochard S, Lempereur M, Remy-Neris O. Accuracy and reliability of three methods of recording scapular motion using reflective skin markers J Eng Med (part H) 2011, 225(1) 100-105. 2. Quellec G, Lamard M, Cazuguel G, Cochener B, Roux C. Adaptive Non-Separable Wavelet Transform via Lifting and its Application to Content-Based Image Retrieval. IEEE Trans Image Process 2010;19:25-35. 3. Chevalier V, Arbab Chirani R, Calloch S. An improved model of 3-dimensional finite element analysis of mechanical behavior of endodontic instruments. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod 2010;109:111-132. 4. Diop EHS, Alexandre R, Boudraa AO. Analysis of Intrinsic Mode Functions: A PDE Approach. IEEE Signal 5. Descourt P, Carlier T, Du Y, Song X, Song I, Frey EC, Bardies M, Tsui BMW, Visvikis D. Angular Response Functions for modeling the collimator/ detector response in SPECT simulations with GATE. Phys Med Biol 2010;55:253-266. 6. Abràmoff MD, Reinhardt JM, Russell SR, Folk JC, Mahajan VB, Niemeijer M, Quellec G. Automated Early Detection of Diabetic Retinopathy. Ophthalmology 2010;117:1147-1154. 7. Tang L, Scheetz T, Mackey D, Alex H, Fingert J, Kwon Y, Quellec G, Reinhardt JM, Abràmoff MD. Automated Quantification of Inherited Phenotypes from Color Images: a Twin Study of the Variability of the Optic Nerve Head Shape. Invest Ophthalmol Vis Sci 2010;IOVS 10-5527v1-10-5527. 8. Zhang H, Shu H, Han GN, Coatrieux G, Luo L, Coatrieux JL. Blurred image recognition by Legendre moment invariants. IEEE Trans Image Process 2010;3:596-611. 9. Jacq JJ, Schwartz C, Burdin V, Gérard R, Remy-Neris O, Lefèvre C, Roux C. Building and tracking root shapes. IEEE Trans Biomed Eng 2010;57:696-707. 10. Quellec G, Lamard M, Cazuguel G, Roux C, Cochener B. Case Retrieval in Medical Databases by Fusing Heterogeneous Information. IEEE Trans Med Imaging 2010;SOUS PRESSE. 11. Chen BJ, Shu HZ, Zhang H, Coatrieux G, Luo LM, Coatrieux JL. Combined Invariants to Similarity Transformation and to Blur Using Orthogonal Zernike Moments. IEEE Trans Image Process 2010;SOUS PRESSE. 12. Arbab Chirani R, Chevalier V, Arbab Chirani S, Calloch S. Comparative analysis of torsional and bending behavior through finite-element models of five Nickel-Titanium endodontic instruments. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod 2010;109:e111-121. 13. Jai Andaloussi S, Lamard M, Cazuguel G, Hamid Tairi, Mohamed Meknassi, Roux C, Cochener B. Content Based Medical Image Retrieval Based on BEMD: use of Generalized Gaussian Density to model BIMFs coefficients. ICGST-GVIP Journal 2010;10:29-38. 14. Almouahed S, Gouriou M, Hamitouche C, Stindel E, Roux C. Design and Evaluation of Instrumented Smart Knee Implant. IEEE Trans Biomed Eng 2010;SOUS PRESSE. 15. Dahabiah A, Puentes J, Solaiman B. Fusion of Possibilistic Sources of Evidences for Pattern Recognition . Integrated Computer-Aided Engineering 2010;2:117-130. 16. Dahabiah A, Puentes J, Solaiman B. Gastroenterology Dataset Clustering Using Possibilistic Kohonen Maps . WSEAS Trans on Information Science and Applications 2010;7:508-521. 17. Lempereur M, Leboeuf F, Brochard S, Rousset J, Burdin V, Remy-Neris O. In vivo estimation of the glenohumeral joint centre by functional methods: accuracy and repeatability assessment. J Biomech 2010;43:370-374. 18. Quellec G, Lamard M, Cazuguel G, Roux C, Cochener B. Medical Case Retrieval from a Committee of Decision Trees. IEEE Trans Inf Technol Biomed 2010;14:1227-35. 19. Quantin C, Jaquet-Chiffele DO, Coatrieux G, Fassa M, Allaert FA. Medical record search engines, using pseudonymised patient identity: an alternative to centralised medical records. Int J Med Inform 2010;SOUS PRESSE. 20. Tomeï S, Reilhac A, Visvikis D, Boussion N, Odet C, Giammarile F, Lartizien C. OncoPET_DB: a freely distributed database of realistic simulated whole body 18F-FDG PET images for oncology. IEEE Trans Nucl Sci 2010;57:246-255. 21. Hatt M, Cheze-Le Rest C, Aboagye EO, Kenny LM, Rosso L, Turkheimer FE, Albarghach MN, Pradier O, Visvikis D. Reproducibility of 18F-FDG and 18F-FLT PET tumor volume measurements. J Nucl Med 2010;51:1368-1376. 22. Niemeijer M, van Ginneken B, Cree MJ, Mizutani A, Quellec G, Sanchez CI, Zhang B, Hornero R, Lamard M, Muramatsu C, Wu X, Cazuguel G, You J, Mayo A, Li Q, Hatanaka Y, Cochener B, Roux C, Karray F, Garcia M, Fujita H, Abramoff MD. Retinopathy Online Challenge: Automatic Detection of Microaneurysms in Digital Color Fundus Photographs. IEEE Trans Med Imaging 2010;29:185-195. 23. Quantin C, Fassa M, Benzenine E, Jaquet-Chiffelle DO, Coatrieux G, Allaërt FA. The Mixed Management of Patients' Medical Records: Responsability Sharing between the Patient and the Physician. Stud Health Technol Inform 2010;156:189-200. 24. Quellec G, Lee K, Dolejsi M, Garvin MK, Abràmoff MD, Sonka M. Three-dimensional analysis of retinal layer texture: Identification of fluid-filled regions in SD-OCT of the macula. IEEE Trans Med Imaging 2010;29:1321-1330. 25. Montémont G, Comtat C, Descourt P, Jan S, Leabad M, Maîtrejean S, Mathy F, Mathieu H, Monnet O, Richer JP, Rossetto O, Rostaing JP, Trébossen R, Verger L, Visvikis D. TOPASE-MED: Rethinking PET imaging with semiconductor detectors. IRBM 2010;31:73-77. 26. Dahabiah A, Puentes J, Solaiman B. Towards a Possibilistic Classification of Gastroenterology Patterns in a Complex Environment. WSEAS Trans on Systems 2010;3:305-316. 27. Dahabiah A, Puentes J, Solaiman B. Towards a Possibilistic Processing of Missing Values under Complex Conditions . WSEAS Trans on Information Science and Applications 2010;4:562-572. 28. Quellec G, Lamard M, Cazuguel G, Cochener B, Roux C. Wavelet Optimization for Content-Based Image Retrieval in Medical Databases. Med Image Anal 2010;14:227-241. 29. Brochard S, Robertson J, Médée B, Remy-Neris O. What’s new in new technologies for upper extremity rehabilitation? Curr Opin Neurol 2010;SOUS PRESSE. 30. Hatt M, Turzo A, Roux C, Visvikis D. A fuzzy locally adaptive Bayesian segmentation approach for volume determination in PET. IEEE Trans Med Imaging 2009;28:881-893. 31. Diop EHS, Boudraa AO, Salzenstein F. A joint 2D AM–FM estimation based on higher order Teager–Kaiser energy operators. Signal, Image and Video Processing 2009;1-8. 32. Pudlo P, Lempereur M, Gorce P, Lepoutre F-X. A new method for simulating the car entering movement. Int. J. Vehicle Design 2009;51:341-358. 33. Hatt M, Cheze-Le Rest C, Descourt P, Dekker A, De Ruysscher D, Oellers M, Lambin P, Pradier O, Visvikis D. Accurate automatic delineation of heterogeneous functional volumes in positron emission tomography for oncology applications. Int J Radiat Oncol Biol Phys 2009;77:301-308. 34. Lancien F, Mimassi N, Le Mével JC. Central effects of trout tachykinins on heart rate variability in trout. Ann N Y Acad Sci 2009;1163:381-383. 35. Le Mével JC, Lancien F, Mimassi N, Conlon JM. Central hyperventilatory action of the stress-related neurohormonal peptides, corticotropin-releasing fator and urotensin I in the trout Oncorhynchus mykiss. Gen Comp Endocrinol 2009;164:51-60. 36. Quantin C, Coatrieux G, Fassa M, Breton V, Jaquet-Chiffelle DO, De Vlieger P, Lypszic N, Boire JY, Roux C, Allaërt FA. Centralised versus decentralised management of patients medical records. Stud Health Technol Inform 2009;150:700-704. 37. Brochard S, Lempereur M, Filipetti P, Remy-Neris O. Changes in gait following continuous intrathecal baclofen infusion for children with cerebral palsy. Dev Neurorehabil 2009;12:397-405. 38. Puentes J, Dhibi M, Bressollette L, Guias B, Solaiman B. Computer Assisted Venous Thrombosis Quantification. IEEE Trans Inf Technol Biomed 2009;13:174-183. 39. Cochener B, Arnould B, Viala M, Roborel de Climens A, Berdeaux G. Corrected and uncorrected near and distance vision with ReSTOR compared to monofocal intraocular lens implantation after cataract surgery: a pooled analysis. Ophthalmologica 2009;223:128-135. 40. Lempereur M, Brochard S, Burdin V, Remy-Neris O. Difference between palpation and optoelectronics recording of scapular motion. Comput Methods Biomech Biomed Engin 2009;13:49-57. 41. Damavandi M, Barbier F, Leboucher J, Farahpour N, Allard P. Effect of methods on the head-neck- trunk moments of inertia in individuals of different morphology. Med Eng Phys 2009;31:880-886. 42. Brochard S, Blajan V, Lempereur M, Le Moine P, Peudenier S, Lefranc J, Remy-Neris O. Efficiency of the analgesic protocol nitrous oxide and topical anesthetic (lidocaïne, prilocaïne) during intramuscular injections of botulinum toxin for children. Ann Phys Rehabil Med 2009;52:704-716. 43. Shidahara M, Tsoumpas C, Hammers A, Boussion N, Visvikis D, Suhara T, Kanno I, Turkheimer FE. Functional and structural synergy for resolution recovery and partial volume correction in brain PET. Neuroimage 2009;44:340-348. 44. Gérard R, Stindel E, Dardenne G, Jacq JJ, Seizeur R, Senecail B, Lefèvre C. Greater trochanter displacements after Charnley’s trochanterotomy, during passive hip movements: a real-time 3D cadaveric approach. Surg Radiol Anat 2009;31:605-613. 45. Le Maitre A, Segars WP, Marache S, Reilhac A, Hatt M, Tomei S, Lartizien C, Visvikis D. Incorporating patient specific variability in the simulation of realistic whole body 18F-FDG distributions for oncology applications. Proceedings of the IEEE 2009;97:2026-2038. 46. Boussion N, Cheze-Le Rest C, Hatt M, Visvikis D. Incorporation of wavelet based denoising in iterative deconvolution for partial volume correction in whole body PET imaging. Eur J Nucl Med Mol Imaging 2009;36:1064-1075. 47. Quantin C, Fassa M, Coatrieux G, Riandey B, Trouessin G, Allaërt FA. Linking Anonymous Databases for National and International Multicenter Epidemiological Studies: a Cryptographic Algorithm. Rev Epidemiol Sante Publique 2009;57:33-39. 48. Pan W, Coatrieux G, Cuppens-Boulahia N, Cuppens F, Roux C. Medical image integrity control combining digital signature and lossless watermarking. Lect Notes Comput Sci 2009;5939:153-162. 49. Quantin C, Coatrieux G, Allaërt FA, Fassa M, Bourquard K, Boire JY, De Vlieger P, Maigne L, Breton V. New advanced technologies to provide decentralised and secure access to medical records: case studies in oncology. Cancer Inform 2009;7:217-229. 50. Chevalier V, Arbab Chirani R, Nicolas M, Morin V. Occurrence of no-function of two electronic apex locators: an in vivo study. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod 2009;108:61-66. 51. Puentes J, Pigeon L, Proulx R, Bergeron-Guyard A, Bélanger D. Optimal Displacement of a Mobile Telemedicine Unit in an Urban Disaster Scenario. Int J Biomed Eng Technol 2009;2:44-73. 52. Dahabiah A, Puentes J, Solaiman B. Possibilistic Pattern Recognition in a Digestive Database for Mining Imperfect Data. WSEAS Trans on Systems 2009;8:229-240. 53. Coatrieux G, Le Guillou C, Cauvin JM, Roux C. Reversible Watermarking for Knowledge Digest Embedding and Reliability Control in Medical Images Information Technology in Biomedicine. IEEE Trans Inf Technol Biomed 2009;13:158-165. 54. Banihachemi JJ, Boidard E, Bosson JL, Bressollette L, Bricault I, Cinquin P, Ferretti G, Marcha M, Martinelli T, Moreau-Gaudry A, Pellissier F, Roux C, Saragaglia D, Thorel P, Troccaz J, Vilchis A. TER: A Robot for Remote Ultrasonic Examination: Experimental Evaluations. Telesurgery 2009;91-99. 55. Dardenne G, Dusseau S, Hamitouche C, Lefèvre C, Stindel E. Toward a dynamic approach of THA planning based on ultrasound. Clin Orthop Relat Res 2009;467:901-908. 56. Hatt M, Cheze-Le Rest C, Dekker A, De Ruysscher D, Oellers M, Lambin P, Roux C, Visvikis D. Une nouvelle méthode de détermination automatique des volumes fonctionnels pour les applications de l'imagerie d'émission en oncologie. IRBM 2009;34:144-149. 57. Teyton P, Metges JP, Atmani A, Jestin-Le Tallec V, Volant A, Visvikis D, Bail JP, Pradier O, Cheze-Le Rest C. Use of FDG Positon Emission Tomography in surgery follow-up of esophageal cancer. J Gastrointest Surg 2009;13:451-458. 58. Le Mével JC, Lancien F, Mimassi N, Conlon JM. Ventilatory and cardiovascular actions of centrally and peripherally administered trout pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP) and vasoactive intestinal peptide (VIP) in the unanesthetized trout. J Exp Biol 2009;212:3919-3927.

Source: http://www.campus-sport-bretagne.fr/downloads/fiche_annuaire_Recherche_latim_CHU_Brest1.pdf

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IMPORTANT - Information for November 2009 small animal clients The Increase of Diabetes Mellitus in Pets The insulin deficience disorder known as Diabetes Mellitus is occuring more To enable us to provide a more effective frequently in household companions. 1 in 200 dogs and 1 in 200 cats are diagnosed service please give us 24-48 hours notice i

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Entretien avec Claude Prey par Michel Rostain / Lyrica n°70, 1981 D'opéra de chambre en opéra épistolaire , L'Escalier de Chambord ne nous dit pas autreClaude Prey s'est imposé en France commechose quand il convoque cinq chanteurs lyriquesl'auteur lyrique contemporain le plus joué. Lepour chanter le rôle de cinq chanteurs réunis surGrand Théâtre de Tours va créer le

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